第二季中湯姆·萊利飾演的達芬奇爲拯救陷入薩帕茲家族的陰謀叛亂危機的佛羅倫城，和同時受了重傷的洛倫佐。達芬奇將挑戰身體和精神的極限來保衛來自羅馬勢力侵襲的佛羅倫城。與此同時，美第奇家族將面臨無法置信的新一輪威脅，達芬奇也將繼續踏上了他使命之路去尋找《葉之書》，去揭開他母親的過去曆史未知真相。達芬奇很快就意識到等待他前面的是致命的使命挑戰 — 比西斯教皇更強勁的敵人！他的探索將帶他到異國他鄉，重新估價他對世界的認識以及對自我過去的評價。